Desde el punto de vista ambiental, el suelo actúa como un sistema natural de regulación, funcionando como filtro, tampón y reservorio de sustancias químicas. La edafología aplicada estudia el comportamiento del suelo frente a contaminantes orgánicos e inorgánicos, nutrientes en exceso y compuestos potencialmente tóxicos, evaluando su movilidad, retención y transformación dentro del perfil edáfico. Las propiedades del suelo, como el contenido en arcillas, materia orgánica, pH y capacidad de intercambio catiónico, condicionan el destino ambiental de estos compuestos.

El suelo desempeña además un papel clave en la protección de las aguas subterráneas y superficiales, limitando la transferencia de contaminantes y regulando los flujos de nutrientes. El conocimiento edafológico permite evaluar riesgos ambientales, diseñar planes de gestión sostenible del suelo y establecer medidas preventivas que reduzcan la contaminación difusa y puntual. En este sentido, la edafología aplicada es una herramienta esencial para la protección del medio ambiente y la salud de los ecosistemas.