Existen dos subespecies reconocidas: Schizanthus porrigens subsp. porrigens y S. porrigens subsp. borealis.

- Schizanthus porrigens subsp. porrigens corresponde a la subespecie típica y se caracteriza por una elevada variabilidad morfológica, especialmente en la coloración de la corola, que puede ser rosa, púrpura, azulada o blanca, así como en el patrón de manchas presentes en los pétalos. Las flores son comparativamente más amplias, destacando por el mayor tamaño y proporciones de sus lóbulos.

Esta subespecie presenta una distribución amplia, desde la región de Coquimbo hasta la región de O’Higgins, donde habita en matorrales esclerófilos, laderas abiertas y zonas con cierta disponibilidad hídrica. Debido a su amplitud ecológica, constituye la subespecie con el rango de distribución más extenso dentro del complejo.

Las imágenes correspondientes a esta subespecie (1 a 4) han sido cedidas por Nicolás Villaseca Merino (@niboldus).

- Schizanthus porrigens subsp. borealis se distingue por presentar flores de color azul-lila uniforme, con manchas muy tenues restringidas a la base de los lóbulos laterales del labio superior y un halo blanco bien definido alrededor del lóbulo superior, lo que genera un patrón floral más fácilmente reconocible que en la subespecie porrigens. Su distribución es más restringida y septentrional, limitada al norte de La Serena, en la región de Coquimbo, donde se desarrolla en laderas sombreadas y en zonas rocosas, como quebradas o afloramientos, ocupando hábitats mucho más específicos que los de subsp. porrigens.  

Las imágenes correspondientes a esta subespecie (5 a 7) han sido cedidas por Nicolás Villaseca Merino (@niboldus)